Di recente ho riscontrato questo problema anche su Mac OS Sierra. Il server Apache funziona ma mysql no. Dopo aver cercato una soluzione, leggendo molti post ho trovato questa soluzione. E ha funzionato!
La soluzione è passare alla cartella mysql, nel mio caso,
/Applications/MAMP/db/mysql56/
e rimuovi tutti i file tranne le cartelle. Quindi riavvia nuovamente MAMP.