Puoi utilizzare updateMany()
metodi di mongodb per aggiornare più documenti
La query semplice è così
db.collection.updateMany(filter, update, options)
Per ulteriori documenti di uppdateMany leggi qui
Secondo il tuo requisito il codice di aggiornamento sarà così:
User.updateMany({"created": false}, {"$set":{"created": true}});
qui devi usare $set perché vuoi solo cambiare creato da vero a falso. Per rif. Se desideri modificare l'intero documento, non è necessario utilizzare $set