Non è necessario archiviare file intermedi, puoi reindirizzare l'output del file s3 su stdout e puoi ottenere input su mongoimport da stdin.
Il tuo comando completo sarebbe simile a:
s3cmd get s3://<yourFilename> - | mongoimport -d <dbName> -c <collectionName>
nota il - che dice invia il file a stdout piuttosto che a un nome di file.
