Potresti provare a memorizzare l'intero documento come una stringa di testo di JSON o una stringa binaria di BSON su GridFS, ma probabilmente non è quello che vuoi, perché quando memorizzi i dati in GridFS MongoDB lo tratta come un blob di dati senza senso e non può eseguire qualsiasi query utile su di esso.
Per ora sarebbe meglio mantenere i dati normalizzati in due raccolte. Quando ciò causa un problema specifico per te, puoi descrivere questo problema in una nuova domanda. Potremmo essere in grado di suggerirti una soluzione più praticabile.