Ho trovato la risposta, piuttosto sciocco da parte mia; devi solo rimuovere le parentesi graffe extra {}
Invece di questo
db.monitor.update({'_id' : 'dbjkdd'}, { '$push':{'pushed_list': {'$each':{lis1}}}})
Usa questo
db.monitor.update({'_id' : 'dbjkdd'}, { '$push':{'pushed_list': {'$each':lis1}}})
ovvero rimuovere '{'
dopo '$each'
e il corrispondente '}'