L'ordine delle proprietà di un documento non influisce sull'indicizzazione.
Puoi verificarlo di persona eseguendo questa query:
db.people.find({LName: "abc"}).explain()
e poi questa query:
db.people.find({LName: "jkl"}).explain()
dovresti vedere che MongoDB utilizzerà l'indice in entrambi i casi (il cursor la proprietà dovrebbe essere qualcosa come "BtreeCursor LName_1_FName_1" ).
