Potresti averlo eseguito con sudo una volta prima. Quando lo esegui con sudo solo una volta e viene scritto un file, i file diventano file root dei file utente root, quindi ha bisogno di più autorizzazioni per essere eseguito e non verrà eseguito normalmente.
Potresti aver eseguito sudo mrt una volta deve avere file aggiornati per un pacchetto, ma ora sono di proprietà di root anziché del tuo normale utente.
Sono sicuro che esiste un comando da terminale per ripristinarlo, ma anche l'utilizzo di Utility Disco e l'esecuzione di "Ripara autorizzazioni disco" può risolverlo (credo).
