Credo che il problema possa risiedere nel fatto che stai fornendo un oggetto Python a app.config.from_object quando si aspetta una stringa. Dai documenti:
app = Flask(__name__)
app.config.from_object('yourapplication.default_settings')
app.config.from_envvar('YOURAPPLICATION_SETTINGS')
http://flask.pocoo.org/docs/0.10/ config/#configurazione-da-file
Quindi nel tuo caso potresti voler fare qualcosa del tipo:
app.config.from_object('your_app.config.{}'.format(config_name))
dove config_name corrisponde all'oggetto nel tuo config.py.
