Per evitare questo tipo di problemi dovresti installare il software solo da repository Debian nativi. Sfortunatamente non è insolito quando pacchetti di terze parti sciatti/incompetenti sono responsabili di tali problemi.
Per recuperare prova a rimuovere il file /var/lib/dpkg/info/mongodb-org-server.postinst
prima di tentare di apt-get purge mongodb
.