Come eseguire comandi mongoDB grezzi usando mongoose?

Prova questo:

YourModel.db.db.admin().command({setParameter: 1, internalQueryExecMaxBlockingSortBytes: <limit in bytes>}, function (err,res)
{
    console.log(res);
});

Aggiornamento:

Puoi farlo anche senza YourModel .

mongoose.connection.db.admin().command({setParameter: 1, internalQueryExecMaxBlockingSortBytes: 268435456}, function (err,result)
{
    console.log(result);
});

Assicurati solo di farlo dopo che la connessione è stata stabilita.