MongoDB trova nella raccolta con chiave sconosciuta

Puoi provare a utilizzare la clausola "$where":

db.items.find({"$where" : function(){ 
    for( var c in this ){
        if( c == "rgDescriptions" ){ 
            for(var i in this[c]){ 
                 for(var j in this[c][i]){
                      if(j == 'name_color' && this[c][i][j] == '8650AC'){
                           return true;
                      }
                 }
             }
        };
     }
     return false; 
}});

Ma avverto che questa clausola è una soluzione "lenta" perché ogni documento deve essere convertito da BSON a un oggetto Javascript e quindi eseguito tramite l'espressione "$where".