Da qui:
Il versionKey è una proprietà impostata su ogni documento quando è stata creata per la prima volta da Mongoose. Questo valore di chiavi contiene la revisione interna del documento. Il nome di questa proprietà del documento è configurabile. L'impostazione predefinita è __v .
Se questo è in conflitto con la tua applicazione, puoi configurare come tale:
new Schema({..}, { versionKey: '_somethingElse' })