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Mongodb trova e modifica il nodo js

La sintassi è diversa nel driver del nodo rispetto alla shell, che è la sintassi che stai utilizzando.

db.collection("collection_name").findAndModify(
    { _id: _id },     // query
    [],               // represents a sort order if multiple matches
    { $set: data },   // update statement
    { new: true },    // options - new to return the modified document
    function(err,doc) {

    }
);

Esiste una funzione separata per .findAndRemove()