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Utilizzo di CHANGETABLE() su tutte le tabelle

Non ho familiarità con questa funzione, ma se il tuo problema è come eseguire query su più tabelle utilizzando CHANGETABLE() quindi presumo che potresti utilizzare una procedura memorizzata per eseguire il loop su tutti i nomi di tabelle ed eseguire la query utilizzando SQL dinamico:

declare 
    @sql nvarchar(max), 
    @parameters nvarchar(max), 
    @TableName nvarchar(128), 
    @Version bigint

set @Version = CHANGE_TRACKING_CURRENT_VERSION()

declare Tables cursor local fast_forward
for 
select name from sys.tables where... -- add conditions here if necessary

open Tables
fetch next from Tables into @TableName
while @@fetch_status = 0
begin
    set @sql = N'select * from CHANGETABLE(CHANGES ' + quotename(@TableName) + ', @LastVersion)ct order by sys_change_version desc'
    set @parameters = N'@LastVersion bigint'
    exec sp_executesql @sql, @parameters, @LastVersion = @Version
    fetch next from Tables into @TableName
end

close Tables
deallocate Tables

Puoi combinarlo con un INSERT nell'SQL dinamico per scrivere i risultati in una tabella da interrogare per il reporting e l'analisi.