Non è esattamente chiaro cosa stai cercando di fare qui, ma puoi creare un identificatore su ogni riga simile a questo:
SELECT Id, 'M' as tbl
FROM MD_Master
UNION ALL
SELECT Id, 'P' as tbl
FROM CD_Personal
Ciò ti consentirà di distinguere tra ogni riga, vedendo da quale tabella proviene il record. Quindi se hai record con lo stesso ID
saprai da dove viene il tavolo.