Due cose:1) ti connetti alla tua istanza PostgreSQL usando la configurazione fornita da Heroku nell'ambiente. Usa semplicemente:
import os
SQL_ALCHEMY_DATABASE_URI = os.environ['DATABASE_URL']
La variabile di ambiente DATABASE_URL
sarà popolato da Heroku e avrà le informazioni di connessione (host, nome utente, password, database).
2) Il filesystem di Heroku è effimero e non persiste tra i riavvii dinamici. Ecco perché il tuo sqlite
il database scompare.