TRUNCATE
deve creare un nuovo file (vuoto) per la tabella, che probabilmente causa il tuo problema. Puoi DROP
la tabella e ricrearla.
Un altro modo più ingombrante sarebbe
DELETE FROM table_name;
VACUUM table_name; -- no FULL!
Mentre VACUUM
normalmente non rimpicciolisce la tabella, troncherà le pagine vuote dalla fine della tabella. Se la tabella è vuota, tutte le pagine verranno rimosse.