Tabella Postgres in array bidimensionale

Una possibilità è prima raggruppare per x e usa array_agg() per ottenere gli array interni. Quindi aggrega di nuovo usando array_agg() per ottenere gli array interni in un array esterno.

SELECT array_agg(a ORDER BY x)
       FROM (SELECT x,
                    array_agg(val ORDER BY y) a
                    FROM t1
                    GROUP BY x) t;