È molto probabile che ciò sia dovuto al fatto che da qualche parte hai un file models.pyc randagio. Cancella tutti i file *.pyc. Puoi provare qualcosa del genere se sei su Linux:
find . -name '*pyc' -exec 'rm' '{}' ';'
Seguilo da ./manage.py makemigrations apihandlers
e poi ./manage.py migrate