Conta il numero di NULL di fila

Non sono sicuro che ci siano metodi più accurati, ma questo dovrebbe funzionare:

SELECT Field1, Field2, ISNULL(Field1) + ISNULL(Field2) Num_Null
FROM   YourTable;

Caso di prova:

CREATE TABLE YourTable (Field1 varchar(10), Field2 varchar(10));

INSERT INTO YourTable VALUES (NULL, 'A');
INSERT INTO YourTable VALUES ('B', 'C');
INSERT INTO YourTable VALUES ('B', NULL);
INSERT INTO YourTable VALUES (NULL, NULL);

Risultato:

+--------+--------+----------+
| Field1 | Field2 | Num_Null |
+--------+--------+----------+
| NULL   | A      |        1 |
| B      | C      |        0 |
| B      | NULL   |        1 |
| NULL   | NULL   |        2 |
+--------+--------+----------+
4 rows in set (0.00 sec)

AGGIORNAMENTO: A seguito della domanda aggiornata:

Se nella tabella sono presenti colonne che assomigliano a affiliate_1 , affiliate_2 , ecc., questa è raramente una buona idea poiché mescoleresti i dati con i metadati. In generale, una soluzione consigliata consiste nell'utilizzare un'altra tabella dipendente per le relazioni tra utenti e affiliati, come nell'esempio seguente:

CREATE TABLE users (
   user_id int, 
   user_name varchar(100),
   PRIMARY KEY (user_id)
) ENGINE=INNODB;

CREATE TABLE users_affiliates (
   user_id int, 
   affiliate_name varchar(100),
   PRIMARY KEY (user_id, affiliate_name),
   FOREIGN KEY (user_id) REFERENCES users (user_id)
) ENGINE=INNODB;

Quindi ordinando gli users la tabella in base al numero di affiliati sarà simile a questa:

SELECT    u.*, d_tb.num_aff
FROM      users
JOIN      (
             SELECT   user_id, COUNT(*) num_aff
             FROM     users_affiliates
             GROUP BY user_id
          ) d_tb ON (d_tb.user_id = u.user_id)
ORDER BY  d_tb.num_aff DESC;

I vantaggi sono molti, ma soprattutto rende le query come quelle sopra facili da scrivere e abbastanza flessibili da funzionare con qualsiasi numero di affiliati (e non limitato dal numero di colonne che hai allocato).