La tua sezione HTML dice:
<a href="includes/delete-customer.php?customer_id=$id['.$row->customer_id.']">
È questa la tua sintassi HTML esatta? Questo argomento dovrebbe essere l'ID numerico effettivo, ovvero --
<a href="includes/delete-customer.php?customer_id=3">
-- sia facendo eco a $row->customer_id
(supponendo che esista) o qualche altro metodo per conoscere quell'ID utente.
Il tuo HTML deve solo inviare i dati effettivi, non qualsiasi tipo di sintassi variabile. Stai ricevendo PHP ($_GET['customer_id']
) lo interpreterà per te e lo passerà correttamente a MySQL.