Non ho MySQL su questa macchina da testare ma penso
SELECT myCol
FROM myTable
WHERE myCol REGEXP '^[0-9][0-9][A-Z]$'
Dovrebbe farlo. ^ è un'ancora per l'inizio della stringa, $ per la fine della stringa e il resto dovrebbe essere autoesplicativo.
Sembra che potresti anche usare REGEXP '^[[:digit:]][[:digit:]][[:alpha:]]$' ma completamente non testato e solo fuori dai documenti.