Non ho MySQL su questa macchina da testare ma penso
SELECT myCol
FROM myTable
WHERE myCol REGEXP '^[0-9][0-9][A-Z]$'
Dovrebbe farlo. ^
è un'ancora per l'inizio della stringa, $
per la fine della stringa e il resto dovrebbe essere autoesplicativo.
Sembra che potresti anche usare REGEXP '^[[:digit:]][[:digit:]][[:alpha:]]$'
ma completamente non testato e solo fuori dai documenti.