MySQL:recupero dell'ID in cui esattamente 2 righe condividono lo stesso ID ma hanno userID diversi

Ecco un approccio performante, che non utilizza affatto subquery. Puoi semplicemente filtrare i risultati in Having clausola, utilizzando l'aggregazione condizionale:

SELECT 
  conversation_id 
FROM assoc_user__conversation 
GROUP BY conversation_id 
HAVING 
  -- all the rows to exists only for 1000001 or 1000002 only
  SUM(user_id IN (1000001, 1000002)) = COUNT(*) 

Risultato

| conversation_id |
| --------------- |
| 10              |

Visualizza su DB Fiddle

Un'altra possibile variazione dell'aggregazione condizionale è:

SELECT 
  conversation_id 
FROM assoc_user__conversation 
GROUP BY conversation_id 
HAVING 
  -- atleast one row for 1000001 to exists
  SUM(user_id = 1000001) AND  
  -- atleast one row for 1000002 to exists
  SUM(user_id = 1000002) AND  
  -- no row to exist for other user_id values
  NOT SUM(user_id NOT IN (1000001, 1000002))