Sono stati segnalati alcuni problemi con scarse prestazioni di RDS da parte delle persone. Anche se Amazon, per quanto ho visto, non ha riconosciuto questi problemi.
RDS (che è solo una versione personalizzata di mysql) utilizza l'ESB per il back-end di archiviazione e, sono sicuro che sei ben consapevole del fallimento che hanno appena avuto con quel servizio.
Ho letto che molte aziende eseguono i propri DB MySQL nelle istanze EC2 perché ha dimostrato di avere prestazioni più affidabili.