Ora() sembra che sarebbe una funzione utile per questo, poiché stai guardando solo un giorno. Forse qualcosa del genere funzionerebbe per te:
SELECT * FROM
(SELECT HOUR(time) hour, avg(ph) AS avg_ph
FROM ph
WHERE time >= NOW() - INTERVAL 1 DAY
GROUP BY hour) p
JOIN
(SELECT HOUR(time) hour, avg(temperature) AS avg_temp
FROM temperature1
WHERE time >= NOW() - INTERVAL 1 DAY
GROUP BY hour) t ON t.hour = p.hour
JOIN
(SELECT HOUR(time) hour, avg(solids) AS avg_solids
FROM solids
WHERE time >= NOW() - INTERVAL 1 DAY
GROUP BY hour) s ON s.hour = p.hour;
Dato che utilizza inner join, presumo che ci sarà sempre almeno un record in ogni tabella per l'ora, ma sembra un'ipotesi ragionevole.