Secondo la documentazione di PropertyValueException, se imposti un valore nullo in una proprietà dichiarata not-null="true" e poi provi a mantenerla/aggiornarla, otterrai questa eccezione.
Vedere http://docs.jboss.org/ hibernate/orm/3.5/javadoc/org/hibernate/PropertyValueException.html
Dovresti rimuovere l'attributo not-null="true" dalla configurazione (perché il valore predefinito di not-null è false) e quindi il database dovrebbe inserire il valore predefinito che hai specificato nella configurazione per te (in questo caso '1 ').
[AGGIORNAMENTO]
Avrei preferito inserirlo come commento nella risposta di fujy, ma non mi è ancora consentito commentare altre risposte. Funziona come previsto se si rimuove l'attributo 'non null' (come mostro di seguito)? Credo che sia ciò che sta causando l'eccezione che stai ricevendo.
<property name="isActive" type="java.lang.Short">
<meta attribute="default-value">1</meta>
<column name="IsActive" />
</property>
