Mysql
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usando php mysqli crea un libro mastro e ottieni il saldo come da DR e CR

Dovresti usare abs funzione:

<td><?php echo abs($total); ?></td>

Nel codice, nella query sql hai ORDER by id desc che significa discendente order by id (l'ultima voce inserita va per prima)Se si desidera modificare l'ordine in crescente quindi rimuovi desc dalla query.