Puoi provare a mettere i nomi dei nodi principali di un elemento in un altro campo della tabella come parent_name
id name parent_name ref_num
1 shiporder root 0
2 orderperson shiporder 1
3 shipto shiporder 1
4 name shipto 3
5 address shipto 3
.....
E poi puoi inserire il ref_num usando la query come indicato nel seguente link
Colonna di aggiornamento MySQL da un'altra colonna in stessa tabella