Dai un'occhiata tu stesso, sai cosa stai cercando nella tua applicazione GIS:http://www.bostongis.com/PrinterFriendly.aspx?content_name=sqlserver2008_postgis_mysql_compare
In generale PostGIS è molto più maturo ed è molto flessibile. Puoi creare qualsiasi funzione, operatore, tipo di indice o altro. Non ha (quasi) limiti.