Prova questo:
SELECT j.id, j.starttime, j.endtime, j.jobname, c.cpuusage
FROM
(
SELECT j.id, j.starttime, j.endtime, j.jobname, MAX(c.usagetime) AS usagetime
FROM jobinfo AS j
LEFT JOIN cpuinfo AS c
ON c.usagetime <= j.starttime
GROUP BY j.id
) AS j
JOIN cpuinfo AS c
ON j.usagetime = c.usagetime
Questo dà l'output che volevi. Trova il valore più recente di cpuusage prima dell'ora di inizio di ogni lavoro. Non gestisce le modifiche in cpuusage mentre il lavoro è in esecuzione.