Ho riscontrato lo stesso identico problema oggi dopo aver apportato una modifica che non dovrebbe influire in alcun modo su Doctrine (ho modificato un Twig modello). Dopo un po' mi sono reso conto che siccome si tratta di uno strano errore di compilazione in un momento strano, probabilmente restarting php-fpm farebbe il trucco. E lo ha fatto.
Forse riavviare Apache fa lo stesso se sei su mod_php .
