C'è un bug registrato su bugs.mysql.com che fa riferimento all'errore che descrivi:
"Bug #37253 Impossibile ripristinare il file di backup contenente BLOB "
La soluzione descritta in quel bug è aumentare il max_allowed_packet
nella configurazione del server MySQL. L'utente ha confermato che l'aumento del valore a 100 milioni gli ha consentito di ripristinare il database.