Il problema con le caselle di controllo (come hai notato) è che quelle deselezionate non inviano alcun dato.
Il trucco standard per aggirare questo problema è...
<input type="hidden" name="field_name" value="0">
<input type="checkbox" name="field_name" value="1">
Quando la casella di controllo è selezionata, il suo valore viene inviato come appare più avanti nel documento. Se deselezionato, viene inviato il valore di input nascosto.
Puoi quindi semplicemente controllare il valore per nome
$field = isset($_POST['field_name']) ? $_POST['field_name'] : false;
$dbFlag = $field ? 'Yes' : 'No';
Nel tuo caso particolare, includi il page_id
nel nome di input, ad es.
<input type="hidden" name="likebutton[416]" value="0">
<input type="checkbox" name="likebutton[416]" value="1">
E in PHP
foreach ($_POST['likebutton'] as $pageId => $likeFlag) {
$dbFlag = $likeFlag ? 'Yes' : 'No';
// update DB
}