MySQL si arresta in modo anomalo (alcuni puntatori potrebbero non essere validi e causare l'interruzione del dump)

Potresti esaminare la modifica di queste proprietà del server mysql:

nano /etc/mysql/my.cnf

query_cache_size=16M
key_buffer_size=256M

O forse anche provare ad aumentare il tempo di esecuzione consentito per la query dal client mysql:

SET GLOBAL MAX_STATEMENT_TIME=1000;

prima di eseguire la query.