La mia risposta è in ritardo, ma potrebbe aiutare i futuri lettori.
Ho avuto lo stesso problema. Durante la lettura della documentazione MySQL sulle opzioni dei comandi MySQL , ho scoperto che puoi usare --init-command parametro.
Quindi la tua riga di comando sarà semplicemente:(-v per dettagliato ed è facoltativo)
mysql --init-command="SET autocommit=0;" -v < sql_file.sql
