L'unica soluzione che ho trovato generalmente applicabile è sviluppare una serie di prefissi e applicarli alle tabelle (ad esempio, le tabelle relative principalmente alle risorse umane inizierebbero tutte hr_). In genere riporto i prefissi ad altri "oggetti" nell'applicazione (moduli, report, viste, stored procedure).
Questa soluzione è tutt'altro che perfetta ed è una specie di hack, ma porta un minimo di ordine al sistema.