Fondamentalmente hai due scelte:
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Esegui un programma SMTP (come Postfix o Sendmail) sul tuo server per ricevere le email e usa procmail per passarle al tuo codice
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ottenere un account e-mail su un servizio host esterno e recuperare l'e-mail utilizzando uno dei pacchetti client POP3 per PHP, come classe-pop3
L'opzione 1 è molto più difficile da fare e devi imparare come amministrare un server di posta elettronica, che non è un compito banale. L'opzione 2 è relativamente semplice ed è quella che consiglierei.