Puoi utilizzare tail insieme allo Strumento a riga di comando MySQL se sei su un sistema simile a Unix come menzionato da Himanshu. Il comando sarebbe:
tail -n +100 dump.sql | mysql -u user -p -D database
Nota:potresti riscontrare problemi a partire da una parte del percorso di un file perché potrebbero esserci riferimenti a valori impostati in un punto precedente del file.