Il più breve è ricreare il database. ma se non vuoi...
Questo è per MySQL/PHP. Non testato ma qualcosa del genere.
$mysqli = new mysqli("host", "my_user", "my_password", "database");
$mysqli->query('SET foreign_key_checks = 0');
if ($result = $mysqli->query("SHOW TABLES"))
{
while($row = $result->fetch_array(MYSQLI_NUM))
{
$mysqli->query('DROP TABLE IF EXISTS '.$row[0]);
}
}
$mysqli->query('SET foreign_key_checks = 1');
$mysqli->close();