Ho affrontato lo stesso problema. Si scopre che il sistema non è in grado di accedere a hibernate-configuration-3.0.dtd dall'URL fornito.
<DOCTYPE hibernate-configuration PUBLIC
"-//Hibernate/Hibernate Configuration DTD 3.0//EN"
"http://www.hibernate.org/dtd/hibernate-configuration-3.0.dtd">
Quindi, l'ho referenziato dal sistema locale.
<!DOCTYPE hibernate-configuration SYSTEM
"classpath://org/hibernate/hibernate-configuration-3.0.dtd">
Ha funzionato bene per me. Spero che ti aiuti!