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Progettazione di database per il sistema delle presenze scolastiche

Quello che stai facendo si chiama ottimizzazione prematura. Questo è un errore comune.

È meglio che la struttura del database sia il più vicino alla realtà e in futuro, se si renderà necessaria l'ottimizzazione o il miglioramento della velocità, sarà sempre possibile farlo.

Per esperienza e guardando il tuo esempio, la soluzione a tavolo singolo sembra a posto.