Puoi proteggere la tua cartella video con un file .htaccess e 'instradare' tutte le richieste tramite uno script php:
RewriteEngine on
RewriteRule (.*) index.php?file_id=$1 [L]
E fai l'autenticazione in index.php
session_start();
// get filename from database or somewhere else
$filename = getFilename($_GET["file_id"]);
if ($_SESSION["is_logged_in"]) {
readfile($filename);
}