Ho riscontrato questo problema con il mio server OTRS dopo aver provato ad aggiornare un pacchetto di grandi dimensioni.
La soluzione era:
copia per sicurezza:
cp /var/lock/subsys/mysqld /root/mysqld
che eliminarlo
rm /var/lock/subsys/mysqld
che chiudere tutti i servizi che dipendono da mysql:
service httpd stop
service otrs stop
dopo di che:
service mysqld restart
service httpd restart
service otrs restart
Il sistema è CentOS 6.x
