Modifica di localhost a 127.0.0.1 risolto il mio problema usando MySQLdb :
db = MySQLdb.connect(
host = '127.0.0.1',
user = 'root',
passwd = '',
db = 'testdb',
port = 3000)
Utilizzando 127.0.0.1 forza il client a utilizzare TCP/IP, in modo che il server in ascolto sulla porta TCP possa prelevarlo. Se host è specificato come localhost , verrà utilizzata una presa o una pipe Unix.