Questo problema è abbastanza comune. Hai bisogno di una sottoquery per eliminare il timestamp massimo e il ratetypeid (che è la base per il raggruppamento) e quindi selezionare tutto il resto da un inner join di queste righe di sottoquery e tutto il resto.
Per MySQL:
SELECT ratecode, rate, id, ratetypeid, date, entrytimestamp
FROM ratedefinitions,
(SELECT ratetypeid, MAX(entrytimestamp) AS max_timestamp FROM Rates
GROUP BY ratetypeid) AS inner_table
WHERE
inner_table.ratetypeid = ratetypeid
AND innertable.max_timestamp = timestamp