La cosa migliore è avere una colonna calcolata per farlo, in modo da poter indicizzare la colonna calcolata e ordinare in base a quella. In caso contrario, l'ordinamento richiederà molto lavoro.
Quindi puoi avere la tua colonna calcolata come:
CASE WHEN title LIKE 'The %' THEN stuff(title,1,4,'') + ', The' ELSE title END
Modifica:se STUFF non è disponibile in MySQL, usa RIGHT o SUBSTRING per rimuovere i 4 caratteri iniziali. Ma prova comunque a utilizzare una colonna calcolata, se possibile, in modo che l'indicizzazione possa essere migliore. La stessa logica dovrebbe essere applicabile per estrarre "A" e "An".
Rob