Nel caso in cui a qualcuno importi ancora:
Ho riscontrato lo stesso problema dopo aver copiato una directory di database direttamente utilizzando il comando
cp -r /path/to/my/database /var/lib/mysql/new_database
Se lo fai con un database che utilizza InnoDB tabelle, otterrai questo pazzo errore "la tabella non esiste" menzionato sopra.
Il problema è che hai bisogno di ib* nella directory principale di MySQL datadir (ad es. ibdata1 , ib_logfile0 e ib_logfile1 ).
Quando li ho copiati, ha funzionato per me.