Non hai bisogno di più chiamate a XMLTable, puoi spostare la selezione dell'elemento nella clausola del percorso della colonna e avere tre di queste clausole:
select x.id1, x.id2, x.id3
from tbl t
cross join
xmltable ('/root'
passing t.xml_data
columns id1 varchar2 (100) path 'element[id=1]/data',
id2 varchar2 (100) path 'element[id=2]/data',
id3 varchar2 (100) path 'element[id=3]/data'
) x;
ID1 ID2 ID3
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abc def