Dalla riga di comando:
mysql -u root -p databaseName < file.sql
Dove databaseName è un database vuoto già creato e file.sql è il file .sql che hai, devi trovarti nella stessa cartella del file quando esegui il comando. Ciò presuppone anche l'utilizzo di root come utente e che sia protetto da password. Modifica secondo necessità per la tua configurazione.
Inoltre, puoi fare il contrario capovolgendo la parentesi angolata per creare un dump del database in un file. Come sotto.
mysql -u root -p databaseName > file.sql