Probabilmente stai facendo qualcosa del genere:
db.collection('allowedmacs').find().toArray(function(err, docs) {
console.log(docs);
});
db.close();
Quindi stai chiudendo il database prima della richiamata a toArray
è stato chiamato (anche se può lavorare in alcune occasioni).
Invece, prova questo:
db.collection('allowedmacs').find().toArray(function(err, docs) {
console.log(docs);
db.close();
});